Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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