Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SEC22CQ9BRL7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SEC22CQ9BRL7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SEC22CQ9BRL7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SEC22CQ9BRL7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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