Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms