Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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