Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms