Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP3Q96P20 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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