Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms