Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms