Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UBE2E2Q96LR5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UBE2E2Q96LR5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UBE2E2Q96LR5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBE2E2Q96LR5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBE2E2Q96LR5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2E2Q96LR5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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