Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms