Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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