Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1LQ96C74 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms