Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPSB1Q96BD6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms