Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms