Protein–RNA interactions for Protein: Q92888

ARHGEF1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1Q92888 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF1Q92888 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF1Q92888 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms