Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms