Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM171Q8WVE6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms