Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA2Q8TDQ7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms