Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD1Q8NHV4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms