Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF248Q8NDW4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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