Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST4Q8NCG5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms