Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms