Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf106Q8NAJ2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms