Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms