Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZW8

TNS4, Tensin-4, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS4Q8IZW8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNS4Q8IZW8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNS4Q8IZW8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNS4Q8IZW8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNS4Q8IZW8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNS4Q8IZW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms