Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms