Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD1L3Q7Z443 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD1L3Q7Z443 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD1L3Q7Z443 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD1L3Q7Z443 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD1L3Q7Z443 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD1L3Q7Z443 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD1L3Q7Z443 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD1L3Q7Z443 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms