Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms