Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms