Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms