Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms