Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD2Q6PL18 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms