Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms