Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC4Q6P2E9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC4Q6P2E9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms