Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms