Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TYW3Q6IPR3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms