Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms