Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GGNBP1Q5YKI7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GGNBP1Q5YKI7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms