Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL1Q5VZK9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms