Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM69BQ5VUD6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms