Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3CQ5U5Q3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms