Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P3

LCE1B, Late cornified envelope protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE1BQ5T7P3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LCE1BQ5T7P3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms