Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3CQ5T2N8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms