Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms