Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms