Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF2Q5BJF6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms