Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCAF6Q58WW2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCAF6Q58WW2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCAF6Q58WW2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCAF6Q58WW2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCAF6Q58WW2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCAF6Q58WW2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms