Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms