Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms