Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms